Grupos de seqüências do genoma SARS-CoV-2 de todo o mundo estão sendo analisados por cientistas para obter informações sobre a doença de Covid-19. Se uma vacina for finalmente descoberta, com base nas sequências agrupadas até o momento, a África poderá encerrar o "Problema da Vacina contra Rotavírus".
O problema da vacina contra rotavírus refere-se à variação observada na eficácia com vacinas desenvolvidas para uso contra infecções por rotavírus, uma das principais causas de diarréia grave entre crianças pequenas em todo o mundo. As vacinas foram consideradas eficazes na Europa e na América do Norte, mas menos eficazes na África. Acredita-se que as vacinas baseadas principalmente em cepas de rotavírus encontradas predominantemente na Europa e na América do Norte exibam menos eficácia na África devido à circulação de diferentes cepas no continente.
Cientistas de países africanos têm trabalhado no seqüenciamento do genoma do Covid-19, mas apenas 90 dos 7.679 realizados em todo o mundo foram realizados até o momento.
"Se os africanos não puderem gerar dados essenciais e disponibilizá-los, podemos sofrer o mesmo destino da vacina contra o rotavírus".
Assim que duas semanas após os casos de uma doença rara do tipo pneumonia foram relatados em Wuhan, uma cidade na China, os cientistas do país realizaram a primeira sequência do genoma do vírus que causa a doença. Em uma semana, eles haviam realizado cinco sequências genômicas de identidades de vírus, como o SARS-CoV-2, um novo coronavírus. Desde então, mais de 7.700 seqüências de genoma foram feitas como o vírus que causa uma doença altamente infecciosa e mortal chamada Covid-19, que se espalha rapidamente pelo mundo. Essas seqüências de genoma agrupadas em vários bancos de dados são vitais para rastrear como o vírus sofre mutação ao longo do tempo à medida que se espalha e para o desenvolvimento de testes de diagnóstico e vacinas. Um desses grupos é o banco de dados de sequências genômicas GISAID SARS-CoV-2.
Observando os dados no banco de dados, a África foi considerada uma mancha escura de dados genômicos SARS-CoV-2. Até agora, a África e a América do Sul representam apenas cerca de 1% do número total de sequências genômicas no banco de dados genômico global SARS-CoV-2.
Acredita-se que deveria haver mais dados genômicos da África para o desenvolvimento de vacinas, levando em consideração as peculiaridades do continente e a possibilidade de uma grande mutação do vírus.
“As vacinas geralmente são desenvolvidas com base nos conjuntos disponíveis de dados de sequência. Portanto, pouca ou nenhuma informação para a África representa pouca ou nenhuma representação no desenvolvimento da vacina ", diz o Dr. Moses Olubusuyi Adewumi, virologista da Faculdade de Medicina da Universidade de Ibadan, na Nigéria". Os africanos não podem gerar dados essenciais e disponibilizá-los; podemos sofrer o mesmo destino da vacina contra o rotavírus ".
A baixa representação das sequências do genoma africano não é o único problema observado. Há também uma baixa distribuição de fontes de sequência no continente. O número de países com o vírus no continente aumenta para 51 quando o Sudão do Sul anunciou seu primeiro caso de Covid-19 esta semana, mas de todos esses países apenas cinco sequenciaram o genoma do vírus.
Em 12 de abril, a República Democrática do Congo, Senegal e Gana respondem por mais de 85% das seqüências genômicas da África.
Somente a RD do Congo representa quase metade do total de seqüências do genoma africano. O Dr. Adewumi vinculou isso à colaboração e financiamento de organizações estrangeiras e ao apoio do governo do país. Ele disse que os recentes surtos do vírus Ebola na República Democrática do Congo levaram ao desenvolvimento de capacidade em alguns laboratórios do país. Embora o Senegal se beneficie da capacidade do Dakar Institut Pasteur, uma das instituições de pesquisa mais conceituadas da África, o Gana está fazendo bom uso de uma instituição de pesquisa do Centro de Excelência (CoE) apoiada pelo Banco Mundial em o país.
A Nigéria também possui um centro semelhante apoiado pelo Banco Mundial, onde a primeira sequência do vírus SARS-CoV-2 foi realizada na África. No entanto, o país suspendeu a sequência do genoma do vírus. O país carece de laboratórios com a capacidade de executar um teste Covid-19; portanto, os laboratórios de genômica que fizeram a sequência agora estão sendo usados como centros de teste.
Segundo o Dr. Adewumi, que atualmente trabalha com um dos laboratórios de testes do University College Hospital, Ibadan, atualmente os testes são a prioridade do governo e o país precisa de mais laboratórios para realizar os testes.
Até o momento, apenas cerca de 5.000 testes foram realizados na Nigéria, em comparação com mais de 14.611 no Gana e mais de 73.028 na África do Sul.
A grande diferença entre o número de testes registrados para a África do Sul e outros países africanos é evidência de sua capacidade laboratorial superior no continente. O país também possui financiamento privado e ocidental para pesquisas, no entanto, apenas seis genomas foram seqüenciados.
A pandemia expandiu as capacidades e recursos das instituições em todo o mundo, mas elas não existem mais na África. Portanto, os países africanos são forçados a escolher entre o diagnóstico e o sequenciamento do genoma em outros para lidar.
Eles escolheram o diagnóstico.
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